O FSH estimula os folículos ovarianos nas mulheres e a espermatogênese nos homens. Seus níveis variam com a idade, aumentando na puberdade. Pode estar elevado em falência ovariana ou testicular e menopausa, e baixo em doenças da hipófise ou hipotálamo. Na síndrome dos ovários policísticos, avalia-se sua relação com o LH.